兽药系是学院特色教学系部之一，开设有“兽药生产与营销”、“兽医医药”、“生物制药技术”、“药品质量检测技术”4个专业。
该系师资学术水平较高，实践经验丰富，年龄、学历、职称结构合理。现有专业教师32人，其中教授3人、副教授12人，具有硕土以上学位25人，省教学名师及优秀教师2人、教育部高职高专教学指导委员会委员1人、农业部新兽药审评委员会委员1人、中国畜牧兽医学会药理毒理学分会常务理事1人、潍坊市畜牧行业协会专家委员会委员1人、潍坊市兽药饲料研究学会委员1人、农业部农业特有工种技能鉴定高级考评员8人，另聘请了20多位企事业单位的专家作为该系学生实践指导教师。

该系科研能力较强。先后主编、副主编教育部、农业部“21世纪国家高职高专规划教材”12部，参编30余部；在国家及省级专业期刊发表论文300余篇，获省部级以上教学、科研成果奖10余项，参与国家级精品课建设1项、省级精品课程4项。

该系实验实训条件先进。建有仪器分析室、理化分析室、抗生素效价测定室、药物合成实训室、药物制剂实训室、中药鉴定实训室、中草药标本室等12个重点专业实验室，配备了“高效液相色谱仪”、“抗生素效价测定仪”、“双波长紫外分光光度计”、“薄层色谱仪”等高精密仪器；建有中草药标本园、教学动物医院、GMP兽药实习药厂、药品质量监控中心、动物疫病检测实训中心等5个校内实训基地，及校外实训基地40余处，为培养高技能医药人才提供了良好的教学实训条件。

所培养的毕业生岗位适应性强、综合素质高，岗位需求量大，初次就业率在99%以上。